Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD11Q96NU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD11Q96NU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms