Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
TSNARE1Q96NA8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSNARE1Q96NA8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms