Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01600Q96MT4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC01600Q96MT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms