Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP57Q96MR6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP57Q96MR6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP57Q96MR6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms