Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCMTD1Q96MG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCMTD1Q96MG8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms