Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC41A2Q96JW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms