Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAGED4Q96JG8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGED4Q96JG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms