Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC4Q96FT7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC4Q96FT7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC4Q96FT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms