Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MISP3Q96FF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MISP3Q96FF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MISP3Q96FF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MISP3Q96FF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MISP3Q96FF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MISP3Q96FF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MISP3Q96FF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms