Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPE2Q96DL1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPE2Q96DL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms