Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC11Q96DB2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC11Q96DB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms