Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC58Q96CX6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms