Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCLNQ969V3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms