Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX21Q969T3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX21Q969T3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX21Q969T3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SNX21Q969T3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX21Q969T3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX21Q969T3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX21Q969T3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX21Q969T3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX21Q969T3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX21Q969T3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms