Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC10Q969S8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC10Q969S8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC10Q969S8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC10Q969S8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms