Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL2Q969S2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL2Q969S2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL2Q969S2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEIL2Q969S2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL2Q969S2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms