Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFKQ969G6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RFKQ969G6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms