Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HGDQ93099 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HGDQ93099 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HGDQ93099 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HGDQ93099 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HGDQ93099 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HGDQ93099 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HGDQ93099 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HGDQ93099 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HGDQ93099 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HGDQ93099 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HGDQ93099 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HGDQ93099 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HGDQ93099 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HGDQ93099 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HGDQ93099 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms