Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
PRG4Q92954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PRG4Q92954 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRG4Q92954 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRG4Q92954 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms