Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAD50Q92878 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAD50Q92878 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD50Q92878 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD50Q92878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms