Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL2Q92772 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL2Q92772 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms