Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTAQ92696 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTAQ92696 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RABGGTAQ92696 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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