Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF516Q92618 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF516Q92618 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF516Q92618 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms