Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT9Q92600 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT9Q92600 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT9Q92600 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT9Q92600 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT9Q92600 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT9Q92600 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT9Q92600 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT9Q92600 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT9Q92600 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT9Q92600 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms