Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC1Q92574 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC1Q92574 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC1Q92574 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms