Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCSTNQ92542 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCSTNQ92542 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCSTNQ92542 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms