Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATAD2BQ8WXI9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATAD2BQ8WXI9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATAD2BQ8WXI9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms