Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHTF18Q8WVB6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHTF18Q8WVB6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms