Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP33Q8TEY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP33Q8TEY7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP33Q8TEY7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms