Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX29Q8TEQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX29Q8TEQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX29Q8TEQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms