Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSH3Q8TE77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SSH3Q8TE77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSH3Q8TE77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms