Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDX54Q8TDD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DDX54Q8TDD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDX54Q8TDD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms