Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPPL3Q8TCT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPPL3Q8TCT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPPL3Q8TCT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms