Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM71BQ8TC56 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM71BQ8TC56 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms