Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGCLL1Q8TB92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCLL1Q8TB92 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms