Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMBQ8TAX9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSDMBQ8TAX9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSDMBQ8TAX9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms