Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HELBQ8NG08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HELBQ8NG08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HELBQ8NG08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms