Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA6DQ8NFY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA6DQ8NFY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA6DQ8NFY4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA6DQ8NFY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA6DQ8NFY4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms