Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C17orf47Q8NEP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C17orf47Q8NEP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C17orf47Q8NEP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms