Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNNM3Q8NE01 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNNM3Q8NE01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNNM3Q8NE01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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