Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP38Q8NB14 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP38Q8NB14 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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