Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TC2NQ8N9U0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TC2NQ8N9U0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TC2NQ8N9U0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms