Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN22Q8N7P3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLDN22Q8N7P3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLDN22Q8N7P3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms