Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL2Q8N4E4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCL2Q8N4E4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCL2Q8N4E4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms