Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO39Q8N4B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms