Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHL34Q8N239 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL34Q8N239 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLHL34Q8N239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms