Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP3Q8IZU3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP3Q8IZU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYCP3Q8IZU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCP3Q8IZU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms