Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NELFCDQ8IXH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFCDQ8IXH7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFCDQ8IXH7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms