Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHERPQ8IWX8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms