Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWU2

LMTK2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK2Q8IWU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMTK2Q8IWU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK2Q8IWU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK2Q8IWU2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK2Q8IWU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms